La recherche de traces d’ADN dans des échantillons environnementaux nécessite l’utilisation de laboratoires et d’équipements spécifiques permettant d’éviter tout risque de contamination au cours de l’analyse.
Des laboratoires spécifiques
Les expertises ADN environnemental (ADNe) offrent aujourd’hui des perspectives extraordinaires pour le suivi et la conservation de la biodiversité. Néanmoins, travailler sur de l’ADN rare occasionne des contraintes importantes. En effet, il est indispensable de garantir que l’ADN amplifié à partir d’un échantillon environnemental n’est pas lié à une contamination. Pour cela, la plateforme d’analyse ADNe doit être composée de plusieurs laboratoires dont certains doivent être équipés d’un système de ventilation permettant un renouvellement important de l’air et une pression différentielle. Le personnel utilisant ces laboratoires doit respecter des pratiques spécifiques à ce type d’analyses et porter des équipements adaptés. Sans le respect de ces exigences, il est impossible d’éviter des contaminations croisées lorsque le nombre d’échantillons analysés devient important.
Une plateforme d’analyse ADN environnemental doit être composée au minimum de quatre laboratoires distincts :
Laboratoire « sans ADN » – Ce laboratoire est principalement utilisé pour préparer les kits d’échantillonnage. Cette salle doit être maintenue en surpression afin d’éviter l’entrée de contaminants extérieurs et être équipée d’un sas d’accès.
Laboratoire « ADN rare » – Les extractions d’ADN à partir d’échantillons d’eau, de sols, de sédiments ou de fèces sont effectuées dans ce laboratoire. L’accès à cette salle, placée en surpression, doit se faire par un sas.
Laboratoire « ADN classique » – Cette salle est utilisée pour réaliser les extractions d’ADN à partir de tissus (pour l’élaboration des bases de références génétiques) et mettre en place les témoins positifs avant l’étape d’amplification.
Laboratoire « ADN amplifié » – Les amplifications d’ADN sont effectuées au sein de ce laboratoire. Il est donc primordial que cette salle soit placée en dépression ou isolée dans un bâtiment séparé afin d’éviter une contamination des autres laboratoires par l’ADN présent en très forte concentration dans cette salle.
Les laboratoires SPYGEN
Afin de garantir la qualité de nos services, SPYGEN dispose d’une plateforme d’analyse de 200 m² créée spécifiquement pour la réalisation d’expertises ADNe. Elle est composée de 5 laboratoires :
-
Sans ADN
-
ADN rare 1
-
ADN rare 2
-
ADN classique
-
ADN amplifié
